AnthropicのClaudeが未知の酵素システムを発見、実験は人間が担う分業体制

Anthropicは、自社の生成AI「Claude」を使った分子生物学研究室の最初の成果を発表しました1。研究チームはClaudeに、巨大なDNA配列データベースから興味深い逆転写酵素を探す課題を与え、Claudeは20万種類以上の逆転写酵素を集めた上で、約3500種類の候補システムから20種類を詳しく解析しました1。この作業には約950のClaudeエージェントが並列で使われ、21時間で合計2億1000万トークンを処理したとのことです1。

作業の途中で1つのエージェントが、ある逆転写酵素遺伝子の隣に規則的なDNA反復配列があることに気づき、既知のシステムとの比較や過去の研究の確認を経て、新しい候補として人間の研究者に報告しました1。研究チームはこの仕組みを「ART」と名付け、バクテリオファージから発見したと説明しています1。ARTは逆転写酵素の遺伝子、機能不明の遺伝子、長いDNA反復配列という3つの要素で構成され、反復配列の並び方はCRISPRに似ているといいます1。最初の実験では反復配列から複数の短いRNAが作られることまで確認できましたが、その機能はまだ分かっていません1。

TechCrunchによると、この研究室は今年の春に設立され、実験そのものは人間の科学者が担っており、扱うのは感染性のない低リスクの生物に限られるとのことです2。

CRISPRとは、細菌がウイルスから身を守るために使う天然の防御システムを応用した遺伝子編集技術のことです。逆転写酵素は、RNAを鋳型としてDNAを作る酵素で、レトロウイルスだけでなく細菌にも複数の種類が見つかっています1。

今回の発表は、Anthropicが先週バクテリオファージなどを扱うウェットラボを運営していると明らかにした直後に出されました2。Anthropicのダリオ・アモデイCEOは、今回の発見がスタンフォード大学の先行研究に基づいたものであり、似た仕組みは以前にも報告があると認めています2。CRISPR研究者のルーカス・ハリントン氏も、成果を単純化すれば「既知の遺伝子と新しい遺伝子の隣に奇妙なDNA反復配列があると分かった」段階に過ぎないと説明しています1。AIを使った生物学研究はAnthropicに限らず、スタンフォード大学やカリフォルニア大学サンフランシスコ校、Googleなども手掛けていると、TechCrunchは報じました2。